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【面上项目】E2/E3泛素杂合酶UBE2O调控Mxi1泛素化降解促进肺癌放疗抵抗的作用机制研究

日期: 来源:生物医学科研之家收集编辑:医药加



【把此国自然题目扔给ChatGPT】

食管癌重要功能蛋白Fascin-K471位点乙酰化与去乙酰化修饰循环失衡的分子机制与临床意义研究

以下是ChatGPT的回复

背景与意义:

肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,其治疗手段主要包括手术、放疗和化疗等。然而,放疗对于肺癌的治疗效果有限,且易出现放疗抵抗。因此,探究肺癌放疗抵抗机制并寻找新的治疗策略具有重要的临床意义。

泛素化是一种重要的细胞内修饰方式,可以调控细胞内蛋白的稳定性、功能和定位等。泛素化酶系统包括E1、E2和E3等多种酶,其中E2/E3泛素杂合酶是泛素化过程中的关键酶。先前的研究发现,E2/E3泛素杂合酶UBE2O在多种肿瘤中高表达,并且参与了肿瘤细胞的增殖、转移和耐药等过程。Mxi1是一种转录因子,具有肿瘤抑制作用。先前的研究发现,Mxi1的泛素化降解可以促进肺癌细胞的增殖和转移,但其泛素化酶尚未明确。

因此,本研究计划探究E2/E3泛素杂合酶UBE2O调控Mxi1泛素化降解对于肺癌放疗抵抗的作用机制,以期为肺癌放疗抵抗的治疗提供新的思路和策略。


研究内容:

1. 检测E2/E3泛素杂合酶UBE2O和Mxi1在肺癌组织和细胞中的表达水平,并探究其与肺癌放疗抵抗的关系。

2. 构建UBE2O和Mxi1的过表达和沉默模型,检测其对肺癌细胞的增殖、凋亡、迁移和放疗敏感性的影响。

3. 利用质谱等技术鉴定Mxi1的泛素化位点和泛素化酶,探究UBE2O与Mxi1的相互作用及其对Mxi1泛素化降解的影响。

4. 探究Mxi1泛素化降解对于肺癌细胞氧化应激和DNA损伤修复的影响,以及其与放疗抵抗的关系。

5. 研究UBE2O和Mxi1的表达与肺癌患者的预后和放疗敏感性的关系。


预期成果:

1. 阐明E2/E3泛素杂合酶UBE2O调控Mxi1泛素化降解促进肺癌放疗抵抗的作用机制。

2. 发现Mxi1的泛素化酶UBE2O,并鉴定其泛素化位点,为进一步研究肺癌的泛素化修饰提供新的思路。

3. 揭示Mxi1泛素化降解对于肺癌细胞氧化应激和DNA损伤修复的影响,为肺癌放疗抵抗的治疗提供新的靶点和策略。

4. 发现UBE2O和Mxi1的表达与肺癌患者的预后和放疗敏感性的关系,为肺癌患者的个体化治疗提供新的参考。


总结:

本研究计划探究E2/E3泛素杂合酶UBE2O调控Mxi1泛素化降解促进肺癌放疗抵抗的作用机制,旨在为肺癌放疗抵抗的治疗提供新的思路和策略,为肺癌患者的个体化治疗提供新的参考。




RNA甲基化进阶数据分析与课题设计研讨会

2023年4月22-23日 北京金泰绿洲大酒店/腾讯会议同步


【会议背景】

RNA甲基化表观转录组当前已成为国自然的热门和CNS期刊的热点。RNA甲基化修饰有170多种类型,包含m6A,m1A,m5C,m7G,假尿嘧啶及ac4C等。m6A修饰作为其中的代表,是研究最为透彻的一种修饰类型,它不仅可以影响RNA 稳定性、剪接、翻译及降解等RNA转录后调控过程,同时调控发育、免疫、神经、疾病等各种生理和病理过程。近年来m6A修饰相关的10分以上文章每年达到300篇以上,且以CNS期刊为代表的高分值文章比例非常高,其研究可谓如火如荼,方兴未艾。此外,其它修饰如m1A,m5C,m7G,假尿嘧啶及ac4C等修饰类型也陆续登场,高分文章频出,大有遍地开花之势。m6A自然也不甘示弱,其调控机制更加多样化,如调控组蛋白修饰,DNA甲基化,转座子,相分离等,真可谓热点大串联。

随着RNA甲基化修饰类型以及调控机制的多样化,掌握各种RNA甲基化修饰的研究思路和技能要点的门槛也日益提高。考虑到RNA甲基化作为文章发表及基金申请的热点,很多博士课题和基金都想搭上这一快车,我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验并有Nature级别文章发表的专家老师为大家详细介绍RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培训使学员熟练的掌握各种甲基化相关课题的数据获得和分析


【会议目标】

由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流程、方法和软件,国自然课题设计思路,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。

【授课专家】

来自知名985高校,长期从事RNA及DNA表观遗传学多组学方面的项目研究,发表Nature,Nature Immunology等杂志60多篇论文。目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。

【主要内容】(详细内容参见日程)

1、RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析

2、RNA甲基化最新测序技术及分析

3、RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析

4、利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请

【授课方式及注意点】

1、理论结合实操,需要有R语言的基础,如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班(一天一晚1500元学费,具体档期请咨询我们)

2、案例讲解分析结合;

3、微信群长期协助分析学员的实际数据

【详细日程表见下表】

第一天上午

8:30-

11:30

各种RNA甲基化功能机制、研究策略及思路解析

1.        多种类型RNA修饰介绍及研究进展概述。

2.        m6A、m1A,m7G,m5C修饰酶介绍及对RNA加工代谢调控作用串讲。

3.        m6A、m1A,m7G,m5C在疾病等领域中的调控功能。

4.        m6A、m1A,m7G,m5C甲基化研究思路和方法。

5.        通过高分文献对RNA甲基化调控肿瘤等思路进行解析。

理论

第一天下午

1:30-

17:00

RNA甲基化最新测序技术及分析

1.       m6A传统及最新测序技术介绍。

2.       m1A,m7G,m5C及假尿嘧啶等修饰测序技术介绍。

3.       m6A,m1A,m7G,m5C及假尿嘧啶等修饰分析内容和常见图形解析。

4.       m6A peak及位点鉴定、peak差异分析、motif分析及peak分布展示等。

5.       其它类型RNA修饰分析流程和软件介绍。

6.       差异甲基化鉴定、注释及富集分析。

实操

第二天上午

8:30-

11:30

RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析

1.       RNA甲基化调控基因表达、剪接研究思路及分析内容。

2.       RNA甲基化调控组蛋白修饰、DNA甲基化等新型调控机制思路设计。

3.       RNA甲基化调控非编码RNA(miRNA,lncRNA及circRNA等)的研究方案。

4.       借花献佛:各种RNA修饰数据库、预测方法介绍及使用。

5.       转录组(mRNA及非编码)、翻译组学分析内容及实操。

6.       转录组+修饰组,翻译组+修饰组整合分析思路及实操。

理论+实操

第二天下午

1:30-

17:00

个性化RNA甲基化课题设计与基金申请

1.       0经费投入项目:RNA修饰酶及关联编码、非编码基因的TCGA及GEO数据挖掘。

2.       标准研究思路介绍(5-10分):RNA修饰基因相关数据分析、实验探究,纯RNA修饰测序图谱研究思路。

3.       高分研究思路介绍(10分+及CNS):多组学解析RNA修饰调控作用轴,结合相分离、免疫、代谢等热点分析和实验思路解析。

4.       RNA甲基化与DNA甲基化、单细胞及空间组学多热点结合。

5.       RNA甲基化相关国自然介绍及未来趋势预测。

6.     讨论及个性化问题答疑。

理论+实操

会议时间2022年4月22-23日

会议地点:线下班:北京金泰绿洲大酒店,线上:腾讯会议网络会议室        

主办方:医药加平台,上海遐锦生物科技有限公司

收费标准:线下班3300元,腾讯会议参加:3000元/人,R语言基础班:1500元/人


优惠政策:

1.  R语言基础班+RNA甲基化进阶课程联报价4000元/人;

2. 三人组团报名,每人优惠100元

3. 四人组团报名,每人优惠200元,

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!

5. 参加过医药加m6a基础班的老学员,只收取500元学费! 

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 

注意事项:携带windows系统的电脑,安装最新版本R和Rstudio

需要有R语言的基础,如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班(一天一晚1500元学费,具体档期请咨询我们)


交费方式:

A:银行转账

账户名称:上海遐锦生物科技有限公司 

账户号:31050179400000001610

开 户 行:中国建设银行上海马陆支行

B:支付宝转账

收款人:yonghong1028@126.com 户  名:金永红

C:微信扫码支付,现场刷卡(仅部分支持)


报名方式:


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2023-03-01












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