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FBE第五期 | 江南大学李兆丰团队:来自海洋细菌的α-琼脂酶的表征和高效生产

日期: 来源:Wiley威立收集编辑:食品生物工程

导读

琼胶酶是一种能将琼脂和琼脂糖降解为具有多种功能活性琼脂低聚糖的酶。与β-琼胶酶相比,α-琼胶酶的天然来源有限,这大大限制了α-琼胶酶的工业应用。江南大学李兆丰团队从海洋细菌Catenovulum maritimum STB14中克隆并异源表达了一种GH96家族的新型α-琼胶酶(Cm-AGA),并对该酶进行了表征,该酶比活最高可达206.1 U/mg。这是首次报道的水解产物主要为琼二糖(A2)和琼四糖(A4)的α-琼胶酶,显示出该酶在低聚合度琼胶寡糖的高效生产中具有重要潜力。



文章简介


琼脂是来源于红藻细胞壁的重要天然多糖。作为琼脂的主要成分,琼脂糖是一种由β -D-半乳糖(D-Gal)和3,6-L-内醚半乳糖(L-AHG)通过α-1,3和β-1,4键交替连接而成的线性聚合物,其具有抗氧化、减肥、抗炎、皮肤美白以及肠道益生等多种生理功能。与通过酸降解的化学法相比,酶催化降解琼脂糖的生产方法具有更好的专一性和环境友好性以及更大的应用潜力。


琼胶酶是特异性降解琼脂和琼脂糖的糖苷水解酶。到目前为止,许多研究集中在属于五个糖苷水解酶类(glycoside hydrolases, GHs)家族的各种海洋微生物来源的β-琼胶酶的催化性质和分子结构上,包括GH16、GH39、GH50、GH86和GH118等家族的成员(http://www.cazy.org/)。然而,迄今为止仅对7种来源的α-琼脂酶进行了表征,还有大量的α-琼胶酶生物资源亟待开发。由于α-琼胶酶分子尺寸较大,结构复杂,且现有α-琼胶酶的稳定性普遍较差,极大地阻碍了其大规模应用。同时,已报道的α-琼胶酶的主要水解产物均为琼四糖(A4),仅可少量产生琼二糖(A2)和琼六糖(A6),不利于特定聚合度(DP)琼胶寡糖的多元化生产和应用。因此,开发催化效率高、稳定性好、产物多样性丰富的α -琼胶酶具有重要的意义。


在本研究中,江南大学李兆丰团队从海洋细菌Catenovulum maritimum STB 14中克隆并异源表达了一种α-琼胶酶(Cm-AGA),通过优化发酵策略显著提高了重组菌的产酶效率,并对Cm-AGA的生化性质和水解产物进行了研究。本研究首次报道了α -琼胶酶主要产生A2和A4两种聚合度的琼寡糖,为琼胶酶的高效制备提供了参考,并推进了琼胶寡糖酶法制备技术的研究进展。

该工作在Food Bioengineering上以题为“Characterization and efficient production of an α-agarase from marine bacterium Catenovulum maritimum STB14”在线发表 (https://doi.org/10.1002/fbe2.12037)

我们精选了文章里的部分内容重点向大家介绍:

1. α-琼胶酶Cm-AGA生物信息学分析

Cm-AGA基因由4398 bp组成,编码1466个氨基酸(GenBank登录号:AYW35328.1)。系w统进化树分析表明,Cm-AGA属于GH96家族。三维结构预测和保守结构域分析结果表明(图1),除催化结构域外,Cm-AGA包含3个用于底物结合的CBM6结构域、1个用于钙离子结合的TSP-3结构域和1个由9个反向平行β-折叠组成的CBM_like结构域。多结构域结构表明Cm-AGA可能是一种具有高度柔性的胞外分泌型α-琼胶酶。


图1 Cm-AGA的三维结构以及结构域分布图


2. 重组Cm-AGA的高效制备


重组Cm-AGA在E.coli BL 21(DE 3)中表达,比活最高可达206.1 U/mg,纯化后通过蛋白电泳检测到对应于约180 kDa的明显条带。为了优化Cm-AGA蛋白的表达情况,本文探究了发酵培养基类型、诱导剂、孵育条件(温度、pH、时间)、碳氮源对重组Cm-AGA生产的影响。结果表明,TB培养基最适合重组Cm-AGA的生产(图2a);IPTG最佳添加时间是在37 ℃ 下培养2 h后(图2b);IPTG最佳添加量为0.01 mM(图2c);最适温度为25 ℃(图2d);最适pH为6.5(图2e);最佳孵育时间44 h(图2f);最佳碳源为果糖,最佳氮源为酵母膏。


图2 发酵培养基组成、诱导剂添加时间与浓度和孵育条件对重组Cm-AGA生产的影响


3. 重组Cm-AGA的表征及水解产物分析


为了探究Cm-AGA的最佳水解条件,本文研究了温度、pH、金属螯合剂和金属离子对重组Cm-AGA酶活性和稳定性的影响。结果表明Cm-AGA在35 ℃活性最高(图3a),并且在30-35 ℃ 稳定性最佳(图3b)。重组Cm-AGA在中性和碱性环境中显示出相对较高的活性(图6c)。此外,Cm-AGA在pH 6.0下表现出最佳的稳定性,在pH 6.0-9.0下孵育6 h后,酶活性保持在70%以上(图6d)。对于金属离子而言,Mn2+和Ca2+能促进酶和底物的结合从而提高酶活性(图6e)。

在上述优化后的条件下进行水解反应,其水解产物通过HPAEC-PAD和UPLC-Q-TOF/MS检测,结果表明A2和A4为主要的水解产物。到目前为止,A2的产生主要依赖于琼脂糖的酸解。这是首次报道α-琼胶酶可同时产生A2和A4,表明Cm-AGA在高效生产低聚合度和特殊生物活性的琼寡糖方面具有较大潜力。此外,产生的A2和A4可被β-半乳糖苷酶(ABG)进一步水解,用于产生L-AHG、D-Gal和聚合度为奇数的琼胶寡糖。


图3 温度、pH、金属螯合剂和金属离子对重组Cm-AGA酶活性和稳定性的影响


结论


本研究从海洋细菌C.maritimum STB14中克隆出Cm-AGA基因并在大肠杆菌BL21中表达。通过发酵策略优化,使重组Cm-AGA的粗酶活提高了6.6倍,并对酶活进行了表征,确定其在35 ℃和pH 8.0下显示出最高活性,并在中性和碱性环境下表现出良好的稳定性。Cm-AGA的活性依赖于金属离子,Mn2+和Ca2+能显著提高Cm-AGA的活性。特别地,Cm-AGA显示了一种新的琼脂糖降解模式,主要产生A2和A4,即Cm-AGA在生产低聚合度琼寡糖中表现出较大潜力。



官网地址

Characterization and efficient production of an α-agarase from marine bacterium Catenovulum maritimum STB14

Yuxian You, Wenyan Xie, Caiming Li, Zhengbiao Gu, Xiaofeng Ban, Feng Zhang, Zhaofeng Li

DOI:https://doi.org/10.1002/fbe2.12037
Citation: You, Y., Xie, W., Li, C., Gu, Z., Ban, X., Zhang, F., & Li, Z. (2022). Characterization and efficient production of an α-agarase from marine bacterium Catenovulum maritimum STB14. Food Bioengineering, 1– 12. 



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关于Food Bioengineering


《食品生物工程(英文)》(Food Bioengineering)创刊于2022年,由华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室和Wiley出版集团共同主办,是聚焦食品生物工程等食品科学与生物工程交叉领域的高水平学术交流平台,创刊主编为赵黎明教授。


官网地址

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/27702081



投稿链接

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