【国自然面上项目】NFIB调控7-DHC代谢重编程抑制去势抵抗性前列腺癌细胞铁死亡机制及精准检验
以下是ChatGPT做的本题目的研究方案
研究方案:NFIB调控7-DHC代谢重编程抑制去势抵抗性前列腺癌细胞铁死亡机制及精准检验
背景:
前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一,去势治疗是其主要治疗手段之一。然而,去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的发生和发展仍然是一个难题。因此,寻找新的治疗策略对于CRPC的治疗至关重要。
研究目的:
本研究旨在探究NFIB调控7-DHC代谢重编程抑制CRPC细胞铁死亡机制,并建立精准检验方法,为CRPC的治疗提供新的思路和方法。
研究内容:
1. 确定NFIB在CRPC中的表达情况及其对7-DHC代谢的影响。
2. 探究7-DHC代谢重编程对CRPC细胞铁死亡的影响及其机制。
3. 建立CRPC细胞铁死亡的精准检验方法。
研究方法:
1. 细胞培养:使用CRPC细胞系,包括去势抵抗性细胞系和敏感细胞系。
2. 实验设计:将细胞分为对照组和实验组,对照组不进行任何处理,实验组分别进行NFIB干扰、7-DHC代谢重编程和铁死亡诱导等处理。
3. 实验方法:采用Western blot、qPCR、细胞增殖和凋亡检测、铁死亡检测等方法,分析NFIB、7-DHC代谢和铁死亡相关蛋白的表达情况及其对细胞生长和死亡的影响。
4. 建立精准检验方法:根据实验结果,建立CRPC细胞铁死亡的精准检验方法,包括铁死亡相关蛋白的检测和细胞铁死亡的评估等。
预期结果:
1. 确定NFIB在CRPC中的表达情况及其对7-DHC代谢的影响。
2. 探究7-DHC代谢重编程对CRPC细胞铁死亡的影响及其机制。
3. 建立CRPC细胞铁死亡的精准检验方法。
意义:
本研究将为CRPC的治疗提供新的思路和方法,为临床治疗提供参考。同时,建立的精准检验方法也将为CRPC的诊断和治疗提供重要的帮助。
宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化研讨会
2023年3月25-26日 腾讯会议网络会议室
微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10倍 —— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。
代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲,脂质组也是代谢组的一种。
宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题,可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。
基于以上原因,医药加推出“宏基因组+代谢组/脂质组联合分析”R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。
本课程通过两天的时间学习,让我们对宏基因组肠道菌群分析,代谢组脂质组小分子分析,以及组学整合数据处理分析,有一个全面的了解。并使用R语言进行分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。
【会议日程】
宏基因组与代谢组学R语言分析及可视化会议日程 | |||
时间安排 | 课程表 | 介绍 | |
第一天 上午 | 9:00- 10:15 | 生信分析思路 |
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10:30-12:00 | R语言基础 |
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第一天 下午 | 13:30- 15:15 | 标准报告解读 |
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15:30-17:30 | 宏基因组生信分析R实操(一) |
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第二天 上午 | 9:00-10:15 | 宏基因组生信分析R实操(二) |
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10:30-12:00 | 代谢组脂质组生信分析R实操 |
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第二天 下午 | 13:30-15:15 | 宏基因组与代谢组数据多组学整合生信分析(R实操) |
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15:30-17:00 | 宏基因组与代谢组数据多组学整合生信分析(在线工具实操) |
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17:15-17:30 | 答疑 |
示例图展示:
示例图箱线图
示例图PCoA图
示例图物种组成柱状图
示例图热图
示例图 venn图
示例图PCA分析
示例图 差异结果
示例图 代谢物的pathway map图
示例图 Lefse树状图
示例图桑基图
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