【国自然面上项目】m6A-RNA甲基化调控黑色素瘤细胞铁死亡的分子机制
以下是ChatGPT做的研究思路
研究方案:m6A-RNA甲基化调控黑色素瘤细胞铁死亡的分子机制
背景:
黑色素瘤是一种高度侵袭性的皮肤恶性肿瘤,目前治疗手段有限。近年来,研究表明m6A-RNA甲基化在肿瘤发生和发展中发挥重要作用。铁死亡是一种新型的细胞死亡方式,其在肿瘤治疗中具有潜在的应用价值。因此,探究m6A-RNA甲基化调控黑色素瘤细胞铁死亡的分子机制,对于黑色素瘤的治疗具有重要意义。
研究目的:
本研究旨在探究m6A-RNA甲基化调控黑色素瘤细胞铁死亡的分子机制,为黑色素瘤的治疗提供新的思路和方法。
研究内容:
1. 确定黑色素瘤细胞中m6A-RNA甲基化水平的变化情况。
2. 构建m6A-RNA甲基化酶METTL3的过表达和敲低模型,探究其对黑色素瘤细胞铁死亡的影响。
3. 筛选与铁死亡相关的基因,利用RNA测序技术分析其在黑色素瘤细胞中的表达情况。
4. 利用CRISPR-Cas9技术敲除铁死亡相关基因,探究其对黑色素瘤细胞铁死亡的影响。
5. 研究m6A-RNA甲基化调控铁死亡的分子机制,包括m6A-RNA甲基化修饰对铁死亡相关基因表达的影响以及m6A-RNA甲基化修饰与RNA结构的相互作用等。
6. 验证研究结果,包括细胞实验和动物实验。
研究意义:
本研究将探究m6A-RNA甲基化调控黑色素瘤细胞铁死亡的分子机制,为黑色素瘤的治疗提供新的思路和方法。同时,本研究还将深入研究m6A-RNA甲基化修饰与RNA结构的相互作用,为RNA结构的研究提供新的思路和方法。
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RNA甲基化进阶数据分析与课题设计研讨会
2023年4月22-23日 北京金泰绿洲大酒店/腾讯会议同步
【会议背景】
RNA甲基化表观转录组当前已成为国自然的热门和CNS期刊的热点。RNA甲基化修饰有170多种类型,包含m6A,m1A,m5C,m7G,假尿嘧啶及ac4C等。m6A修饰作为其中的代表,是研究最为透彻的一种修饰类型,它不仅可以影响RNA 稳定性、剪接、翻译及降解等RNA转录后调控过程,同时调控发育、免疫、神经、疾病等各种生理和病理过程。近年来m6A修饰相关的10分以上文章每年达到300篇以上,且以CNS期刊为代表的高分值文章比例非常高,其研究可谓如火如荼,方兴未艾。此外,其它修饰如m1A,m5C,m7G,假尿嘧啶及ac4C等修饰类型也陆续登场,高分文章频出,大有遍地开花之势。m6A自然也不甘示弱,其调控机制更加多样化,如调控组蛋白修饰,DNA甲基化,转座子,相分离等,真可谓热点大串联。
随着RNA甲基化修饰类型以及调控机制的多样化,掌握各种RNA甲基化修饰的研究思路和技能要点的门槛也日益提高。考虑到RNA甲基化作为文章发表及基金申请的热点,很多博士课题和基金都想搭上这一快车,我们特别邀请到在该领域拥有丰富经验并有Nature级别文章发表的专家老师为大家详细介绍RNA甲基化的研究内容、研究方向及课题思路,并通过培训使学员熟练的掌握各种甲基化相关课题的数据获得和分析
【会议目标】
由多年从事表观遗传与RNA甲基化的科研人员授课,通过深入浅出的理论讲解和实例案例,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平,增加职业竞争力。通过本次课程培训将使学员系统掌握当前主流的表观遗传与RNA甲基化分析流程、方法和软件,国自然课题设计思路,从零基础实现到CNS图表的绘制,同时提升研究深度和广度,拓宽研究思路。
【授课专家】
来自知名985高校,长期从事RNA及DNA表观遗传学多组学方面的项目研究,发表Nature,Nature Immunology等杂志60多篇论文。目前承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
【主要内容】(详细内容参见日程)
1、RNA甲基化功能机制、研究策略及思路分析
2、RNA甲基化最新测序技术及分析
3、RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析
4、利用公共数据库和多组学数据进行甲基化课题设计及基金申请
【授课方式及注意点】
1、理论结合实操,需要有R语言的基础,如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班(一天一晚1500元学费,具体档期请咨询我们)
2、案例讲解分析结合;
3、微信群长期协助分析学员的实际数据
【详细日程表见下表】
第一天上午 8:30- 11:30 | 各种RNA甲基化功能机制、研究策略及思路解析 | 1. 多种类型RNA修饰介绍及研究进展概述。 2. m6A、m1A,m7G,m5C修饰酶介绍及对RNA加工代谢调控作用串讲。 3. m6A、m1A,m7G,m5C在疾病等领域中的调控功能。 4. m6A、m1A,m7G,m5C甲基化研究思路和方法。 5. 通过高分文献对RNA甲基化调控肿瘤等思路进行解析。 | 理论 |
第一天下午 1:30- 17:00 | RNA甲基化最新测序技术及分析 | 1. m6A传统及最新测序技术介绍。 2. m1A,m7G,m5C及假尿嘧啶等修饰测序技术介绍。 3. m6A,m1A,m7G,m5C及假尿嘧啶等修饰分析内容和常见图形解析。 4. m6A peak及位点鉴定、peak差异分析、motif分析及peak分布展示等。 5. 其它类型RNA修饰分析流程和软件介绍。 6. 差异甲基化鉴定、注释及富集分析。 | 实操 |
第二天上午 8:30- 11:30 | RNA甲基化、转录组及翻译组学整合分析 | 1. RNA甲基化调控基因表达、剪接研究思路及分析内容。 2. RNA甲基化调控组蛋白修饰、DNA甲基化等新型调控机制思路设计。 3. RNA甲基化调控非编码RNA(miRNA,lncRNA及circRNA等)的研究方案。 4. 借花献佛:各种RNA修饰数据库、预测方法介绍及使用。 5. 转录组(mRNA及非编码)、翻译组学分析内容及实操。 6. 转录组+修饰组,翻译组+修饰组整合分析思路及实操。 | 理论+实操 |
第二天下午 1:30- 17:00 | 个性化RNA甲基化课题设计与基金申请 | 1. 0经费投入项目:RNA修饰酶及关联编码、非编码基因的TCGA及GEO数据挖掘。 2. 标准研究思路介绍(5-10分):RNA修饰基因相关数据分析、实验探究,纯RNA修饰测序图谱研究思路。 3. 高分研究思路介绍(10分+及CNS):多组学解析RNA修饰调控作用轴,结合相分离、免疫、代谢等热点分析和实验思路解析。 4. RNA甲基化与DNA甲基化、单细胞及空间组学多热点结合。 5. RNA甲基化相关国自然介绍及未来趋势预测。 6. 讨论及个性化问题答疑。 | 理论+实操 |
会议时间:2022年4月22-23日
会议地点:线下班:北京金泰绿洲大酒店,线上:腾讯会议网络会议室
主办方:医药加平台,上海遐锦生物科技有限公司
收费标准:线下班3300元,腾讯会议参加:3000元/人,R语言基础班:1500元/人
优惠政策:
1. R语言基础班+RNA甲基化进阶课程联报价4000元/人;
2. 三人组团报名,每人优惠100元
3. 四人组团报名,每人优惠200元,
4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!
5. 参加过医药加m6a基础班的老学员,只收取500元学费!
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:携带windows系统的电脑,安装最新版本R和Rstudio
需要有R语言的基础,如您没有R语言基础需要提前参加R语言基础班(一天一晚1500元学费,具体档期请咨询我们)
交费方式:
A:银行转账
账户名称:上海遐锦生物科技有限公司
账户号:31050179400000001610
开 户 行:中国建设银行上海马陆支行
B:支付宝转账
收款人:yonghong1028@126.com 户 名:金永红
C:微信扫码支付,现场刷卡(仅部分支持)
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