人乳头瘤病毒(HPV)感染是导致肛门生殖器癌的主要原因，HPV整合到宿主基因组是一个关键步骤；然而，目前在全基因组转录水平上的致癌机制仍然知之甚少。2023年3月2日，武汉大学胡争团队在Nucleic Acids Research 上在线发表题为“HPV integration generates a cellular super-enhancer which functions as ecDNA to regulate genome-wide transcription”的研究论文。

该研究对6个HPV阳性和3个HPV阴性细胞系的多组学数据进行了综合分析。通过HPV整合检测、超级增强子(SE)鉴定、SE相关基因表达和染色体外DNA (ecDNA)研究，探索了HPV整合的全基因组转录影响。

该研究总共确定了7个由HPV整合产生的高级别细胞SEs (HPV断点诱导的细胞SEs, bp-SEs)，导致染色体基因的染色体内和染色体间调节。途径分析表明，异常染色体基因与癌症相关途径相关。重要的是，研究人员证明了BP-cSEs存在于HPV -人杂交ecDNA中，解释了上述转录改变。该研究结果表明，HPV整合产生了具有ecDNA功能的细胞SEs，调节无约束转录，扩展了HPV整合的致瘤机制，并为开发新的诊断和治疗策略提供了见解。

来源：iMedicines、病毒学界