■ 导读

阳文龙等利用拟南芥同源序列比对方法，对异源四倍体芥菜(Brassica juncea)的WOX (WUSCHEL related-homeobox)转录因子家族进行了全基因组鉴定分析，成功获得51个WOX基因家族成员。他们还从进化关系、基因结构、表达特征等方面对这些WOX同源基因进行系统性检测分析，推测该基因家族可能参与芥菜的生长发育和多个胁迫信号响应。

摘要：WUSCHEL相关-同源盒(WUSCHEL related-homeobox,WOX)基因家族是一类植物特有的转录因子基因家族，在植物的生长发育过程中发挥重要作用。本研究利用芥菜(Brassica juncea)基因组数据，通过HUMMER、Smart等软件进行检索筛选，共鉴定出51个WOX基因家族成员。利用Expasy在线软件对这些家族成员的蛋白质分子量、氨基酸序列长度、等电点等进行分析，并利用生物信息学软件对芥菜WOX基因家族进化关系、保守区域、基因结构等进行系统性分析，将芥菜WOX基因家族分为古老支、中间支和WUS支/现代支3个亚家族。结构分析表明，同一亚家族内的WOX转录因子家族成员的保守结构域的种类、组织形式以及基因结构具有高度的一致性，而不同亚家族之间呈现一定的多样性。51个WOX基因不均匀分布于芥菜18条染色体上，这些基因的启动子大多含有响应光、激素和非生物逆境胁迫相关的顺式作用元件。利用转录组数据和实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR)分析发现，芥菜WOX基因的表达具有时空特异性，其中BjuWOX25、BjuWOX33、BjuWOX49可能在角果的发育中发挥重要作用，BjuWOX10、BjuWOX32和BjuWOX11、BjuWOX23分别在干旱和高温胁迫响应中具有重要功能。上述结果为芥菜WOX基因家族的功能研究奠定了基础。

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