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导师简介:何柏毅,西湖大学工学院助理教授(生命科学学院兼聘),目前主要研究方向为微生物群的定量工程,广泛研究方向包括生物物理学、合成生物学、微生物生态与进化学等;研究成果提供了剖析微生物组复杂性的高通量实验方法和数学模型,以在Cell、eLife、Nat Commun等期刊上以第一或通讯作者发表。2014年获耶鲁大学物理学学士学位,2019年获哈佛大学应用物理学博士学位,2019年至2023年在斯坦福大学从事博士后工作。实验室主页:https://ho.lab.westlake.edu.cn实验室介绍或课题组主要研究方向:微生物群落对宿主的健康产生广泛且重要的影响,其工程是改善宿主健康的重要工具。我们的实验室通过结合数学模型和高通量实验将微生物组改造变为量化工程,重点关注于人类肠道菌群,主要研究方向和手段包括:微生物互作机制、微生物组进化实验、微生物生态与进化学数学模型、自动化群落组装实验、代谢组学、基因组学等。我们是一个交叉学科实验室,欢迎不同学科背景的学者加盟,一起在微生物组和其它生命系统里寻找定量原理。具体研究方向:为了设计微生物群的组成和功能,我们建立理论和实验工具来剖析复杂的群落,重点关注于人类肠道菌群:- 广泛微生物群的物种丰度表现出特殊的时间波动,这些波动可以通过资源竞争的数学模型来重现(Ho et al,eLife 2022)。我们正在利用这关系来推断各种微生物群的动态启动因素。- 我们构建了一个兼具高度多样性和明确性的模式群落,此群落可重复性地定植于小鼠肠道,而且被模式群落或人类粪便群落定植的小鼠在表型上是相似的(Cheng*, Ho* et al, Cell 2022)。我们正在量化此模式系统中各物种的相互作用。微生物通过许多机制进行互动,包括资源竞争、代谢交叉和环境调控。我们利用群落组装实验、代谢组学、基因组学和数学模型把个别的机制解开:- 我们能够通过单个肠道菌种的代谢组学来预测体外的群落动态(Ho et al,bioRxiv 2022)。我们正在运用类似方法来研究复杂环境中和进化过程中的微生物相互作用。- 抗生素作用可以影响物种间的资源竞争,反之亦然,这种相互作用可以导致多种抗生素之间的协同或抑制作用(Newton, Ho+, and Huang+,Nat Commun 2023)。我们正在使用高通量筛选实验测试这些模型预测,并利用它们来设计群落动态。我们诚聘各阶段的学者,包括博士后,博士生,科研助理和本科生。- 已获得或即将获得微生物学、系统生物学、生物信息学、生物物理学、物理学、计算机学等相关专业博士学位;
- 不限专业;具有微生物群落构建、深度测序和代谢组学研究经验或具有数学建模、计算机编程能力的候选人优先考虑;
薪酬与福利待遇:根据个人科研工作能力和西湖大学博士后有关规定从优发放。实验室将提供稳定的工作环境与一流的研究平台,协助申报博士后相关项目,并根据兴趣与需求支持个人的职业发展。对获得中国博士后科学基金资助和浙江省博士后择优项目资助的,杭州市给予1:1配套资助。对出站留杭(来杭)工作的博士后,杭州市给予每人40万元补助。- 本科及以上学历,微生物学、系统生物学、物理学、计算机学等相关专业;
- 具有微生物群落构建、深度测序和代谢组学研究经验或具有数学建模、计算机编程能力的候选人优先考虑;
薪酬与福利待遇:根据西湖大学相关规定以及申请人工作能力,实验室将提供在国内外具有竞争力的薪酬待遇以及科研条件,享受五险一金及西湖大学的相关福利。具体待遇面议。博士生和本科生:如果你有兴趣加入我们,请联系何柏毅博士讨论机会。博士后:https://www.westlake.edu.cn/Careers/OpenPositions/202303/t20230322_26706.shtml博士生:https://www.westlake.edu.cn/admissions_aid/graduate/科研助理:https://www.westlake.edu.cn/Careers/OpenPositions/202303/t20230322_26701.shtml请准备求职信(简要地描述研究经历和未来研究兴趣)、个人简历和2-3位推荐人联系方式,进行投递,应聘理由请注明:“应聘[岗位]-本人姓名”。投递简历请选择:西湖大学工学院何柏毅课题组
简历投递方式(可选任一):
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