讲座信息

讲座主题：序列、结构、功能和表型：从结构预测谈起

日期：2023年8月29日（周二）晚20:00-21:30

主讲嘉宾介绍

周耀旗

周耀旗教授，深圳湾实验室系统与物理生物学研究所资深研究员、副所长。

于2021年3月起全职加入深圳湾实验室。他是1984年中国科技大学近代化学系的学士，1990年美国纽约州立石溪大学化学物理的博士，1994-2000年北卡州立大学、哈佛大学的博士后，2000年任纽约州立布法罗大学助理教授，2004年升为终身副教授，2006年成为印第安纳大学信息学院和医学院终身正教授，2013-2021年任澳大利亚格里菲斯大学糖组学研究所正教授。他长期在结构生物信息学方面工作，曾经多次在国际结构预测和功能预测比赛中名列前茅。他的科研成果的原创力和影响力获得了世界专家同行的肯定，入选了2021-2022年度全球前2%顶尖科学家“终身科学影响力排行榜”和“年度科学影响力排行榜”，“中国高被引学者（生物学）榜”等。到目前为止共发表同行评审的论文250多篇，包括Nature、Nature Methods、Genome Biology、Nucleic Acids Research等国际知名期刊。谷歌学者总引用17,000余次，H因子69。目前，周教授课题组通过AI计算和高通量实验的结合，从事蛋白质/RNA的序列、结构与功能关系方面的基础研究和生物分子检测、药物开发方面的应用研究。

报告摘要

生物高分子的序列与表型的关系，是通过它所折叠的结构及结构所承载的功能而体现出来。虽然有60多年的努力，在2018年前，蛋白质结构预测的进展甚少 --- 这是从1994年起，每两年一次的国际蛋白质结构预测竞赛（CASP）所得到的结论。然而，在2018年CASP13中出现的AlphaFold第一次体现出预测精确度的质的飞跃；而2020年CASP14中AlphaFold2近乎完美的表现则进一步震惊了科学界，它所预测大多数蛋白质的结构能够与实验所获得的精度比美。在2018-2020年间，到底发生了什么？AlphaFold2是从何而来，又会带我们去何处？特别是，AlphaFold2在蛋白质上的成功能够在RNA结构预测、蛋白质/RNA功能预测，致病突变上能够复制吗？在这个报告里，我将试图回答这些以及其它值得深思的问题。

主持人介绍

马剑鹏

马剑鹏教授，博士生导师，国际著名计算生物学家。现任复旦大学复杂体系多尺度研究院院长、上海人工智能实验室领军科学家。

复旦大学化学系学士，美国波士顿大学博士，哈佛大学博士后，师从Martin Karplus教授（2013年诺贝尔化学奖得主）。曾任美国贝勒医学院（Baylor College of Medicine）和莱斯大学（Rice University）终身教授，贝勒医学院冠顶教授，清华大学生命科学学院教授，美国医学生物工程学会会士，美国科学促进会会士及美国物理学会会士。2018年，马教授作为上海市高峰人才引进团队核心成员全职归国，与诺贝尔化学奖得主Michael Levitt教授联合创建复旦大学复杂体系多尺度研究院。研究方向为生物物理、计算生物学及结构生物学，致力于发展针对生物体系研究的人工智能计算方法，与实验手段相结合，解决复杂生物体系中的重要问题。近年来，在AI for science领域尤为关键的蛋白质结构预测研究中，马教授团队自主研发的OPUS-系列国产软件性能领跑全球，成功搭建全链条AI-赋能新药研发的先进技术平台。此外，马教授屡获国际学术大奖，如2004年Norman Hackermann化学研究奖等，带领团队发表多项研究成果于Nature、Science及PNAS等顶尖学术期刊。

主办单位

上海国际人类表型组研究院

Phenomics表型组学期刊

复旦大学人类表型组研究院

中国生物物理学会表型组学分会