讲座信息

讲座主题：生物信息数据整合及其在肿瘤微环境研究的应用

日期：2023年9月5日（周二）晚20:00-21:30

主讲嘉宾介绍

张泽民

张泽民博士，国家特聘教授，长江学者，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）主任、北京大学生命科学院终身讲席教授、北大-清华生命联合中心资深研究员。

张教授在2014年加入北大以前就任美国基因泰克近16余年，负责生物信息学和癌症基因组学研究，挖掘抗癌靶点。他实验室目前致力于用前沿的基因组学和生物信息学技术来解决癌症生物学中的核心问题，包括应用单细胞测序技术来研究肿瘤微环境，在基因组水平研究肿瘤免疫以及各种细胞成分对肿瘤功能和药敏的影响。他作为通讯作者在Nature, Science, Cell正刊杂志发表12篇文章，总SCI引用近3万次；其中发表的二十多个生物信息工具被引用一万多次，4次入选中国生物信息学十大进展。他领导的肿瘤免疫微环境研究获得了2021年北京市自然科学一等奖。他担任了国家卫计委精准医学研究重点专项首席科学家，承担了国家自然科学基金重点和重大项目，现任国自然重大研究计划指导组专家成员。他也是几个国际顶尖杂志（包括Cell, Cancer Cell, Cancer Discovery, Cell Research，Cell Systems）的编委。

报告摘要

单细胞技术对免疫细胞的功能状态识别与干预策略研发产生了根本性的影响，尤其使得我们有能力对肿瘤免疫中的众多核心问题进行全新的解析。我们利用生物信息学方法和单细胞组学技术，深度研究了多种实体瘤中肿瘤浸润免疫细胞的功能状态，并在跨癌种水平上进行了系统性的比较，进而以此为基础，揭示了肿瘤患者免疫治疗响应差异的分子机制。在前期泛癌种T细胞和髓系细胞的基础上， B细胞，NK细胞，和成纤维细胞，鉴定了更多和肿瘤微环境相关的细胞亚型以及它们的具体特征。最终，我们发现了肿瘤微环境的整体特征、异质性、和临床特征的相关性。这对肿瘤免疫的新靶点的发现、以及和临床预后相关的生物标记物的鉴定提供了前瞻性的基础。 

主持人介绍

曹志伟

曹志伟， 复旦大学生命科学学院计算生物学系主任，上海国际人类表型组研究院免疫表型组学研究所副所长。2004-2007上海生物信息技术研究中心副研究员/主任助理；2007-2021，任同济大学教授，曾任副院长，创建同济生物信息系。担任2021-2025 科技部 BT-IT融合重点研发专项指南编制专家、实施方案论证专家，科技部生物中心2021-2035国家中长期科技发展规划生物信息子领域执笔人。兼中华中医药学会中医药信息分会副主委，世中联中药系统科学与工程专委会副会长，Journal of Cellular Biochemistry 执行主编等。

承担国家重点研发计划、精准医学、973、863、传染病重大专项和自然科学基金以及上海市项目十余项；发表Nature，Nature Communications, Nucleic acids research, Molecular Biology & Evolution 等SCI文章130多篇。研究聚焦于新药AI 智能计算方法，在解析抗体抗原分子识别规律的基础上，建立了抗原空间表位预测系列算法，继而设计研发了不依赖免疫实验数据集训练的抗原免疫交叉保护计算系统CE-Blast，为新发传染病疫苗免疫原智能设计提供关键计算技术。同时，在国际上率先建立了“复方－中药－成分－代谢－靶点”数据资源共享平台，创立了高精度多成分协同药效预测模型，形成了基于大数据的中医药独特计算分析策略。

主办单位

上海国际人类表型组研究院

Phenomics表型组学期刊

复旦大学人类表型组研究院

中国生物物理学会表型组学分会