本报讯 (记者朱晓娟 通讯员张玉元)近日,郑州大学第一附属医院韩新巍团队利用大数据挖掘生物医学信息研究取得突出成绩,成功搭建了实体肿瘤标志物研究平台和基于机器学习开发的肿瘤相关预后研究平台,为精准医学和个性化诊疗提供了强有力的数据支持。
韩新巍团队相关研究成果分别发表在《Molecular Cancer》(分子癌症)和《Signal Transduction and Targeted Therapy》(信号转导和靶向治疗)等杂志上。据统计,该团队2023年在生物医学信息领域发表中科院一区12篇、二区14篇研究论文,其中3篇发表在顶级期刊。
韩新巍团队自2020年开始,从介入器械的材料、表面改性和药物涂层方向研究,向肿瘤多组学、单细胞测序和大数据生物医学信息领域拓展,挖掘医学大数据,并成功搭建了实体肿瘤标志物研究平台和基于机器学习开发的肿瘤相关预后研究平台。团队整合了来自21个国家、364个中心的27种实体肿瘤,收集样本超过5万个,内容涵盖了丰富的临床和分子数据,为精准医学和个性化诊疗提供了强有力的数据支持。团队搭建的研究平台实现了对复杂数据的多元化分析和机器学习算法的调用,页面操作简单便利,大大简化了科研过程,有效助力临床科研高质量发展。
通过几年的努力,目前,韩新巍团队在大数据医学信息研究及生物医学信息领域的实验研究方面均取得突出成果。第一项研究成果介绍了定期间隔的短质体重复序列(CRISPR-CAS9)介导的基因组编辑和强大的CRISPR工具箱的机制,专注于审查CRISPR诱导的双链断裂对癌症免疫疗法(基因敲除或敲除)的影响。讨论了基于CRISPR-CAS9的全基因组筛查,以加大目标识别,强调空间CRISPR基因组学的潜力,并提出了CRISPR-CAS9的基础研究,转化医学和诊疗中的全面应用与挑战。
第二项研究成果旨在探讨多源活性氧(ROS)影响肿瘤微环境(TME)中的凋亡,自噬和抗肿瘤免疫反应以及这三个过程之间的相互串扰机制。鉴于ROS在控制细胞命运和免疫力中的复杂作用,将进一步研究传统的癌症治疗与ROS之间的关系,并力争探讨一些潜在的与ROS相关的治疗方案。
易于感染、疫苗接种功效不佳以及与年龄相关的疾病发作,和肿瘤与衰老伴随的先天性和适应性免疫功能障碍有关(免疫衰老)。在衰老期间,生物体发展出一种特征性的炎症状态,这种慢性炎症是与免疫衰老密切相关的现象,被认为是年龄相关疾病的主要危险因素。受干扰的T细胞池和慢性抗原刺激介导了免疫细胞的过早衰老,而衰老免疫细胞会形成促炎性衰老相关的分泌表型,从而加剧炎症,提示衰老的T细胞和炎症可能是免疫衰老中的主要驱动力。
第三项研究成果主要讨论了免疫衰老潜在的应对措施,包括细胞衰老和代谢——遗传轴的干预以减轻免疫衰老。近年来,免疫衰老在肿瘤发育中的作用引起了越来越多的关注,其在临床试验和药物研究方面都取得了一些令人震惊的结果,后期有必要更进一步研究免疫衰老在癌症和其他与年龄有关的疾病中的作用,本文提出了未来进一步研究的方向与设想。