阿拉伯帝国的创建者、先知穆罕默德逝世时，因未对其继承人的产生方式作出任何指示，所以先知去世后，伊斯兰世界在哈里发人选问题上随即发生分裂。

在神权共和时代，哈希姆家族虽然和先知同属一脉，但是倭马亚家族的奥斯曼·本·阿凡成为第三任哈里发。他大力扶持本家族成员在帝国境内担任军政要职，引发很多人的不满。

而倭马亚家族，在先知穆罕默德创建伊斯兰教时，曾对先知施加迫害，因此哈希姆家族非常反对奥斯曼成为哈里发，由此引发两大家族的对抗。

公元656年奥斯曼·本·阿凡遇刺身亡，先知穆罕默德的堂弟兼女婿阿里·本·艾比·塔里卜继任哈里发。但是奥斯曼的堂侄、叙利亚总督穆阿维叶则拒不承认阿里的哈里发地位。

穆阿维叶是穆罕默德传教时代的宿敌阿布·苏富扬的儿子，在公元630年麦加被穆罕默德占领后与父亲一起皈依了伊斯兰教，并获得穆罕默德的信任。

穆阿维叶于在其堂叔奥斯曼任哈里发时代，获得对整个叙利亚的军政统治权，完全把叙利亚当作自己的私人领地来经营，并且积聚了雄厚的军事力量。

阿里继承哈里发之位后，穆阿维叶挑起内战。公元657年，穆阿维叶在隋芬战役中依靠“真主裁决”的伎俩战胜阿里，成为哈里发，建立倭马亚王朝。

公元679年，穆阿维叶宣布其子叶齐德为哈里发继承人，从而将伊斯兰哈里发选举制度破坏，阿拉伯帝国从此成为由世袭王朝统治的封建国家。

而阿里的追随者在阿里被刺杀后，成立了什叶派，成为倭马亚王朝最大的反对者。什叶派坚持认为哈里发一职，只能从先知女婿阿里的后代中产生。

在整个倭马亚王朝时期，中央政府与什叶派的战争一直持续不断，但什叶派从未被彻底剪除。什叶派最后协助阿拔斯王朝，终结了倭马亚家族的统治。

由于与什叶派的持续冲突，倭马亚王朝的统治长年陷于不稳定状态之中，以至数位倭马亚王朝哈里发死于刺客之手。而且，几乎所有倭马亚王朝哈里发的在位时间都极短。

最终，先知穆罕默德家族后代阿布·阿拔斯，利用什叶派与哈瓦利吉派暴动之机，借助波斯人军事力量最终推翻了倭马亚王朝，哈希姆家族重新掌控阿拉伯帝国。

作为对穆阿维叶当初窃取阿里政权的抱负，在倭马亚王朝覆灭后，几乎所有倭马亚家族成员都遭屠杀。只有一名幸存者阿卜杜勒·拉赫曼逃至西班牙，在那里建立了后倭马亚王朝。

穆阿维叶驱逐哈里发阿里，建立了倭马亚王朝，等于时窃取了哈希姆家族的胜利果实，也给倭马亚带来了灾难，随着倭马亚王朝的覆灭，倭马亚家族几乎遭到灭顶之灾。