李自成并没有打算长期留守北京，所以他在山海关战败后，匆匆登基做了皇帝，便带着无数财宝西逃。多尔衮的命令是一路追击到山西，所以当大顺军逃入山西以后，多尔衮的军队便停止了进攻。

让人意想不到的是，李自成包括刘宗敏在内的核心军事领袖，全都没有留在山西，而是直接渡过了黄河，逃回了陕西西安。陕西全境虽然都有重兵把守，而且兵力上跟满清比起来是有优势的。可是没有一个指挥全局的帅才坐镇山西，这是后来悲剧发生的主要原因。

当时李自成对山西全境的部署大致是这样的。

晋东南地区吩咐大将刘忠把守，山西大同、阳和两地则让制将军张天琳负责当地业务，而大将马重禧把守固关。这种安排看似还是比较合理的，但是再看看他对山西其他地区的安排，则显得有些尴尬。尤其是山西省会太原，李自成居然留给了明朝降将刘永福，倒不是说刘永福是降将所以不靠谱，而是太原的重要性李自成并没有了解。

再看晋西北保德地区，则是明朝降将唐通来镇守，难道李自成手下就没有嫡系将领了吗？这种安排实在让人有些匪夷所思。因为不全是大顺嫡系，所以根本无法统一指挥。而且最富有军事才能的帅才刘宗敏，在这个时候也没有留在山西。

原本打算将山西作为决战地点的李自成，做梦也没有想到，山西内部居然率先出现了危机。

• 原来大明朝的大同总兵姜瓖是投降大顺政权的，可是他发现大顺军队在山海关大战的时候，表现太一般了，所以他认为大顺政权应该不是满清的对手，所以姜瓖便在五月初十的时候发动叛乱。他将在大同镇守的大将张天琳杀掉，宣布大同独立，依旧属于大明王朝。但是为了增加政治筹码，他没有立刻投降满清，而是选择了枣强王朱鼎登基为帝，延续大明的香火。到了六月十六日这一天，姜瓖就已经投降了满清。
• 看到姜瓖在大同起兵成功后，反复无常的小人唐通也想要趁机捞一笔。他在保德州发动叛乱，也跟姜瓖学习，沿用明朝番号，自认为自己还是崇祯皇帝的军队。为了争取一些投降的资本，所以唐通利用自己在陕西和山西交界处的优势，向陕西的大顺军发起了进攻。击败了大顺军的陕北大将李过，并且占领了十几个州县。在这种情况下，多尔衮自然是向唐通递出了橄榄枝。而唐通的爵位也因此上升一级，从大明朝的定西伯提升为大清朝的定西侯。
• ​因为姜瓖和唐通的叛变，直接导致山西全境不战而降，大顺军残余部队为了自保，纷纷退回到了陕西境内。唐通的做法更加过分，他已经越过黄河，占领了陕西部分州县，所以为后来多尔衮夺取陕西提供了强有力的据点。李自成得知这个消息以后，立刻将握在手里的唐通母亲和儿子全部杀掉，就像当年杀掉吴三桂全家一样。其实他从来没有好好考虑过一件事，为什么人家投降了你，又立刻反叛你呢？而且降将反叛为什么会对李自成大军造成如此大的危难呢？

李自成对这些降将的部署，本身就有很大问题。

• 李自成在收容这些降将的时候，完全当成自己人来任用。

所以这些人到了李自成这里，也没有得到多大提升，连个侯爵都舍不得给人家。这是这些降将心里所不愿意看到的事情，因为他们缺乏安全感，只有爵位高了，他们才能真正为大顺政权卖命，这一点多尔衮做的十分到位，他舍得给官，反正都是嘴巴动一动的事情，何乐而不为呢？

• 李自成对降将过于放纵，将他们安插在各路重要位置。

这是非常忌讳的一件事，本身降将的忠诚程度，就必须要先考察一番。可是李自成对这些降将十分有信心，他连官爵都没有给人家增加多少，就如此信任人家会为你卖命。这些降将占据山西境内各路要塞，而且都是统领自己原来的人马，一旦反叛，那对山西地区的战局是致命的。

结局：从1644年到1645年，仅仅一年时间内，从大明朝投降大顺的将领们，几乎没有一个例外地反叛大顺，投降了满清政府。

所以满清政府压根就没有出兵，便轻而易举地夺取了山西。李自成在部署山西军务的过程中，负有绝对的责任。墙倒众人推，在山西全境被满清攻占以后，在南方投降大顺军的那些官绅们，也蠢蠢欲动，相继发生了各种叛乱。

南方战事也处于一片混乱之中，这些官绅甚至认为北方的吴三桂是拥立崇祯的太子朱慈烺为帝，所以他们才会选择反顺复明。到了这种生死关头，李自成真正所能掌握的，其实就只有陕西这一块发源地了。