光绪二十六年（1900年），因慈禧太后强词借口带走珍妃不便，留下又恐其年轻惹出是非，有辱皇家颜面，被投井杀害，享年24岁。

1901年春，清廷与八国联军讲和，慈禧、光绪还朝。慈禧见珍妃所投之井依然如故，便命人将尸骨打捞出来，装殓入棺，葬于阜成门外恩济庄太监公墓南面的宫女墓地，企图以“贞烈殉节”的名义掩世人耳目，并为此将珍妃追封为珍贵妃。

慈禧死后，载沣将珍妃的死因从“投井自杀”改为“被崔玉贵投入井中溺亡”。民国四年（1913年）珍妃姐姐瑾妃做了太妃，才将她迁葬回崇陵妃园寝，并在珍妃井北侧的门房为她布置了一个小灵堂以供奉珍妃的牌位，灵堂上悬挂一额纸匾，上书“精卫通诚”，颂扬珍妃对清德宗的一片真情。

井口只有10寸珍妃是如何被推进去的？原来是这样的，我们看到的珍妃井的确是当年的珍妃井，只不过后来慈禧西逃回来后在原来的井口上加了一个石头井沿，用铁棍穿过锁住，从此禁用，珍妃井的真正井口远远大于10寸，而我们今天看到的只是井口石而已！