1895年11月18日总督府宣称全岛平静，翌年3月废止军政，恢复民政，然而台湾各地武装抗日运动却此起彼伏。北部之武装抗日：宜兰方面，有林火旺、林木火、蓝继明和蒋老福等；澳底、草岭、瑞芳和基隆方面，有林李成、詹振等；淡水、金包里方面，有简大狮、卢锦布、李勇和李豹成等；三角涌方面，有王猫研等；桃园方面，有陈瑞荣、林凉、林天义、许才和林清云等。多以游击战方式，与日军周旋数年，使日军疲于奔命。

日治时期的台湾民众

1897年6月26日，乃木希典总督施行“三段警备制”。三段警备制首先于1897年10月31日在台北县开始制定，并在管辖区域执行，其他各地则于1898年3月以后逐步实施。1897年9月至1898年11月间，日本改设“内台一体”的宪兵条例，撤废台湾宪兵队名义，在宪兵司令部之下，编成日本内地7队、台湾3队的宪兵队，每队各分10个分队，当时驱使的宪兵人数超过警察。当时日本本国宪兵总数不到1万人，而台湾则使用3400余名。可知此时宪兵所扮演的角色，远远超过宪兵之本职。

乃木希典

1900年2月，台湾总督府人事更迭。儿玉源太郎任总督，后藤新平就任民政长官。两人俱为日本有数之政治家，尤其儿玉乃现役大将，以武人而具有政治手腕。而后藤新平则渐渐发展其所谓的“治台三策”，认为台湾人怕死，要用高压的手段来威吓；台湾人要钱，可以用小利诱惑；台湾人重面子，可以用虚名笼络。总督府检讨过去以武力威逼之政策，以为是劳而无功，于是决定采用招抚政策。一方面于3月举行“扬文会”，召集清代生员以上举人、拔贡、岁贡、恩贡和廪生等儒生士绅151名，在台北淡水馆开会。总督府一一发出邀请函，并且附上修保庙宇、旌表节孝和救济赈恤等议题，请受邀者各抒所见。另一方面又以诱降、欺骗为目的，令辜显荣招降嘉义林武琛，专心探查柯铁虎动静。更利用斗六街吴克明吴克明、郑芳春郑芳春等人，不惜以优待条件，劝诱柯铁虎投降。

儿玉源太郎

于是，在台湾的北部，1900年中在宜兰姑婆寮、平林尾等处，有徐禄、陈文流、叶加令、陈锡宾、林三传和陈炎等暗带武器，时常出入于日军、宪、警包围搜查之中，但终不能给予日军以多少打击。嗣后，彼等或被迫走入番界；或远走他乡，变姓换名，以度余生。北部之抗日战，此后遂不得再见有组织之行动。至于中、南部台湾之抗日战，日军于1902年4月发动大量兵力，消灭抗日首领阮振、黄国镇和林添丁；其次于5月25日，在斗六、林圯埔等六处归顺式场中，骗杀张大猷等抗日分子几百人；5月30日围攻林少猫，迫其战死，武装抗日势力大致被镇压殆尽。

（张宪文、张玉法主编：《中华民国专题史第15卷》 ）