湘军陆师在九江、梅家洲没能取得突破，湘军水师亦未能打破梅家洲的战场僵局，此时的湘军已经远离湖南，后勤补给不免有些顾虑。湘军要想摆脱当下的僵局，快速将战事推进必须想办法撕开石达开布下的严密防御网。太平军的水师质量整体水平低于湘军水师，特别是在半壁山、田家镇大战中太平军水师受到了重创。所以曾国藩决定以己之长，攻彼之短，用水师的优势作为突破取胜的关键力量。太平军庐山、九江、梅家洲一带的防线始终是湘军的心腹大患，湘军入鄱阳湖切断太平军补给线的整体作战方案不变。

拖罟模型

经过湘军水师的第一次冲击之后，太平军在鄱阳湖口的水面防御工事松散了许多（后来的事实证明，这是石达开的诱敌之计）。湘军水师泊于梅家洲长江水域一带，准备发起对鄱阳湖的第二次冲击。湘军水师的作战特点是拖罟等大船居中指挥，舢板轻舟负责护卫、掩护，组成了较严密的作战体系。面对太平军松散的水面防御，曾国藩认为经过第一次冲击，太平军的水营暂时不能对湘军水师构成大的威胁，于是湘军派萧捷三、段莹器、孙昌国、游击黄翼升等率领一百二十多艘长龙船、舢板轻舟及两千多精锐水师兵力第二次冲击鄱阳湖口防御，准备再次杀入鄱阳湖中。

湘军水师入湖作战

太平军在鄱阳湖口停泊了一些破旧的大船并用锁链相连，简陋地封锁了鄱阳湖入口。萧捷三率领水师顶住两岸太平军的火力网，很快摧毁了太平军的水面防御，冲入了鄱阳湖中。虽然太平军水面防御松散，湘军水师冲过湖口时还是损失了不少兵力。萧捷三的部队进入鄱阳湖后对鄱阳湖岸内的太平军运输船只进行了疯狂攻击，对岸边的太平军进行了疯狂报复，鄱阳湖内的太平军损失甚重。萧捷三率领部队在鄱阳湖内肆无忌惮，一度深入到了大姑塘一带，他完全没有意识到见好就收的道理。

入湖湘军水师被困

萧捷三的队伍在湖内作战三天，击毁太平军船只百余艘，缴获三十余艘，还有几十门大炮。三天后，萧捷三得知湖外出了大事便立刻原路返回。当他来到湖口时被吓呆了，鄱阳湖口面貌已经焕然一新，一条河坝由东岸向西延伸，仅在梅家洲处留出了可通舢板的狭窄航道。原来萧捷三进入鄱阳湖后，石达开命人往大船装满石头，运至鄱阳湖口航道处，再凿沉大船。不断下沉的大船很快构筑了一条堤坝，阻断了鄱阳湖的内外通道。太平军还在堤坝上放置火炮，形成了拦江火力网。萧捷三看到此情此景，万念俱灰：硬冲出狭窄的出口，全体将士必将沉尸湖中；弃船上岸简直等于送羊入虎口。进入鄱阳湖的湘军水师，被太平军封锁长达一年半之久。