一直以来，皇帝的陵寝都是由自己生前选好，或者是由自己的后辈为其挑选，但是嘉庆帝的陵寝却是由他的父亲乾隆帝挑选的。

据说，昌陵原是乾隆为自己选定的万年吉地，后乾隆有旨谕：“后吉地，各依昭穆次序，在东陵、西陵界内分建。”意思是父子两代皇帝不可在同一陵区建陵。所以乾隆又在东陵另选了陵址，与祖父康熙相守，把西陵太平峪赐给了儿子嘉庆，让其与祖父雍正为伴。也就是说，康熙帝和乾隆帝葬在东陵，而雍正帝与嘉庆帝葬在西陵。

而昌陵在建成后不久引发了一系列的风波。当时，嘉庆帝处理了起清朝以来最大的陵寝工程贪污案。在这件大案中有两个官员被斩，众多官员被革职、流放，而首犯嘉庆帝的大舅子盛住被发配到乌鲁木齐。

据史载，盛住是个品行不端的人，仗着自己是皇亲国成，在承修皇陵期间屡生事端，惹怒了嘉庆帝，被发配乌鲁木齐后，于嘉庆十年死去。但是，盛住命好，这桩陵寝贪污案直到嘉庆十三年六月，也就是盛住死后三年，才被人揭发出来。盛住共扣留了9万多银两，这让嘉庆帝大为震惊，但因盛住已死，无法追究其责，只得对其他有关人员进行了严惩本来，嘉庆帝发现有人贪污、克扣修建陵寝的银两已经非常生气了，但是接下来的一份奏折更是让他怒上加怒。

这封奏折向嘉庆禀明了昌陵的现状：宫门、明楼等处出现了雨水渗漏的情况，殿内有油漆和小碎木脱落等。嘉庆帝派人前去察看，发现陵寝多处处损坏，许多建筑都需要修理。

昌陵竣工不久就发生了如此严重的渗漏，这在清朝陵寝史上是少见的。虽然嘉庆帝对此非常震惊，但不得不命人赶紧修理。这次大修分了两次进行，共花费银两35000多两。此外，这次昌陵重修，派出的勘估大臣职位之高、人数之多是极为罕见的。

与嘉庆帝同葬昌陵的是孝淑皇后，另一位孝和皇后则辟址另建陵墓。这两位皇后虽然埋葬的地方不一样，但是她们的人葬史却同样的曲折。

孝淑皇后于嘉庆二年去世。按照惯例，在皇帝健在的情况下，应该先把皇后安放在皇陵地宫，陵寝不能封门，直到皇帝去世入葬后才能封陵。就在皇陵建好，大家准备将皇后安葬的时候，写奏折的人糊涂无才，引起了一场轩然大波。

皇后入葬前，会有专人按照固定的撰写词句写一份奏事议折。这次负责的人由于粗心大意，竟然把“掩闭石门、大葬礼成”这八个字加进去了。嘉庆帝一看就怒了：“石门怎么可以掩闭？闭上还能开吗？这是先皇当年赐给朕的吉地，又不是赐给皇后的。你们把门关上了，将来打算让朕再另找吉地吗？说什么“大葬礼成”，朕死了吗？就大葬礼成”了？”

奏折虽然被修改了过来，嘉庆帝也处罚了犯错的官员，但还是不难看出嘉庆朝中无良才的弊端。

第二位入葬比较曲折的皇后是孝和皇后。孝和皇后是道光皇帝的母亲，做了二十多年的皇太后。按照惯例，皇后陵应该在其成为皇太后不久后就修建，但是不知何故，在道光皇帝在位的二十多年时间里，他都没有营建皇后陵。直到孝和皇后死后一个月，道光皇帝才派人到西陵为她选陵址，定陵名为昌西陵。奇怪的是，就在道光为孝和皇后选好陵址的两天后，道光皇帝也驾鹤西去了。

昌西陵原先定址于昌陵以西、昌陵妃园寝以南。但是，负责陵工的官员发现那里的土皮下竟然有沙石和泉水。不得已的情况下，咸丰皇帝将陵址定在了昌陵妃园寝以西的望仙山上。昌陵在清朝皇帝陵史上有着特殊的地位和价值，是中国皇陵的最后绝唱。