三藩之乱中，为了抓住有利战机，康熙帝一再谕令指挥湖北清军的将领勒尔锦、指挥浙江清军的康亲王杰书、指挥江西清军的安亲王岳乐等不要犹豫观望，坐失战机，劳师糜饷，而要抓住有利战机积极进攻，不给叛军以整顿、喘息的机会。他特别再三谕令岳乐，在稳住江西战局以后，立刻由袁州人长沙，截断叛兵粮道,夹击岳州。康熙果断地认为，由袁州直取长沙，一以断叛兵的粮道，二来可缓他们的兵势，三则扼制广西咽喉，四又可固守江西门户。这样一来，叛兵便会自动瓦解，而荆岳之地的清军就可迅速向前推进。遗憾的是，这几支大军对贯彻康熙的作战意图很不得力。特别是湖北的清军主帅勒尔锦,几年来一直驻守江北，观望犹豫，未能坚决渡江，从而使战局长期处于相持状态。就在这个节骨眼上，陕西的王辅臣响应国家的号召造反了。

这一造反，让本来就乱七八糟的战局更加火上浇油了，主要是这老铁还很倔强，王八吃秤砣式造反，宁死不降那种，不降也就不磨蹭了，康熙帝一句话，打，往死里打。结果就是全部优势兵力都向王辅臣进攻，分分钟，灭掉了。王部主力被击溃后，为了瓦解叛军，康熙帝未追究王辅臣袭杀莫洛举兵叛乱的罪行，而是仍旧恢复了他昔日的官爵,还授予了他靖寇将军的称号，命其驻守陕西汉中阻止叛军由四川北进。这种战略部署充分体现了康熙帝的军事指挥能力这样的安排，使吴三桂首尾没办法兼顾，而且最重要的是抢占了四川之后，大有得陇望蜀之感。

我们需要注意的一点就是。清朝实际上是一个少数民族政权，是由满族人以及满族贵族通知的，虽然表面上宣称满汉一家，但是实际上统治者的心中还是更加倾向于自己的人，但是康熙帝在这场战争中的一个做法深得民心，就是真的做到了一视同仁，无论汉族还是满族，凭实力领军，何种做法一是可以稳定军心，使得占军队大部分的汉族将士更加死心塌地的为他卖命，而且，还使得老百姓们对于清廷的态度发生了转变。其中王进宝、赵良栋被授予进攻四川叛军的全权，他们各自指挥一路，英勇善战，连克重镇,迅速攻下四川大部分地区。在广西各族人民中享有较高威信的骁将傳弘烈，被康熙帝授予抚蛮灭寇将军兼广西巡抚之职，并且被赋予在广西讨叛的全权。他在清将莽依图等人的配合下，收复了广西大部分地区，只可惜其后来被叛将诱捕，不屈就义。

三藩之乱的助理虽然是三大巨头，但是由于种种原因，真正的叛乱情况比想象的要复杂得多，而且整个中国版图，都打得乱七八糟，各种起义不断地那种。这对于刚即位不就的康熙帝，尤其是还未满20资历尚浅的他来说可以说是生死攸关的大考验，但是康熙之所以被尊称为康熙大帝，就表明他有足够的能力，而康熙的能力体现的最好的就是平定这次叛乱上，他很冷静的分析了敌我形式，在出于劣势的情况下依然有序组织防御进攻。使清廷稳住阵脚吴三桂看到清军来势凶猛，严整难犯，不禁暗暗为康熙帝的治军才能惊叹不已。这是谁也没想到的，本来吴三桂之所以敢造反的原因之一就是看在康熙帝年级太小，没啥资历和威望，所以才发动叛乱，而自己兵强马壮，在云南等地根基稳固，简直是天赐的良机，不造反都对不起自己手下的兵，但是出人意料的是，偏偏自己碰上的是康熙。

这个时候的吴三桂，已经感受到颓败之势，甚至开始质疑自己当时的决定，产生了退出的想法。从此，他再也无心继续发动大规模的攻势了。因此，他一人湖南，就委托折尔肯等人持疏文即刻回京，希望索回子孙，与清廷划地讲和。然而，他等到的却是清廷绞死吴应熊父子并布告天下的消息。吴三桂此时的内心是崩溃的，他没有想到，小小年纪的康熙帝，竟有这份魄力，自己原本想威胁他，做到不战而屈人之兵，但是没想到等到的结果竟然这么决绝。所以，现在的形式已经很明确了，这场战争非打不可了，吴三桂虽然有一战的实力，但是他内心还是比较抗拒与清廷开战的。

在各个战场上，清军都获得了反攻的初步胜利。这次战略反攻所取得的胜利尽管不是决定性的，但它却为清军以后的战略总反攻奠定了坚实的基础，在相当程度上加速了平叛战争的胜利进程。

在陕甘战场上，康熙十四年(1675)四、五月间，清军洞鄂部在甘肃与王辅臣部交战，王部在临洮、洮州、河州连续败阵。闰五月，清军回兵花马池和秦州，包围兰州。六月，王辅臣连续失绥德、兰州、延安等城，被清军截断了与四川联络的通道。七月,王辅臣被围于平凉。九月，王辅臣攻克固原。洞鄂部进驻陕甘时，清朝一面争取甘肃提督张勇协同作战，加封张勇为靖逆侯，一面又派出使臣向王辅臣招降。康熙帝在诏谕中甚至说王辅臣杀莫洛，是由于莫洛“心怀私隙”，“朕之知人未明”，“咎在朕躬”。清军围攻平凉，再次颁布诏书赦免城内官兵。六月，王辅臣开城降清。清廷赦免他的反叛之罪，恢复原官职，加封太子太保，随图海驻军汉中。陕西地区的反清战争失败了。

在浙赣闽战场上，清军杰书与岳乐两路分别向浙江和江西进军，直取福建，向耿精忠展开攻击。清军仍然‘剿抚并用”，在进军途中招降叛兵。康熙十四年(1675年)四月，岳乐在江西招抚官兵五万多人。五月，败耿军于长兴，占领南昌,闰五月,耿精忠反击，攻取饶州，旋又被清军夺回。此时的战争局势天平已经慢慢的向清军倾斜，在各个战场上，清廷部队捷报连连，反而叛军武装节节败退。削藩的前途，已经十分明朗了。