2018年9月28日，扬科维奇出任中国U-19（1999年龄段）国家男子足球队黄队主教练。2020年10月26日，扬科维奇完成续约，带领中国U-21（1999年龄段）国家男子足球队备战杭州亚运会。2022年7月，扬科维奇带领中国国家男子足球选拔队出战2022年东亚足联E-1锦标赛。