Science - 大规模在体CRISPR筛选

Science | 大规模在体CRISPR筛选

http://science.sciencemag.org/content/early/2021/08/18/science.abi8870

CRIPSR筛选技术直接大规模操纵基因筛选表型,是关键的基因功能研究技术,但是长期以来只用细胞系体外筛选,大大限制了可以检测的表型以及可以回答的问题(1, 2)。

犹他大学Randall Peterson等研究人员开发新技术MIC-Drop(Multiplexed Intermixed CRISPR Droplets)实现了在体CRISPR筛选。

结合微流控技术大规模制备同时含有CRISPR基因编辑复合物(sgRNA与Cas蛋白组成的复合物)DNA标签微液滴并注射到斑马鱼胚胎,以及后续高通量成像,研究人员做到了同时分析上百个功能未知基因,并新鉴定了与心脏发育相关基因(3)。

研究人员认为将来可以进一步扩大通量、扩展到非编码基因以及其它模式动物

该工作2021年8月19日发表在Science(3)。

Science | 大规模在体CRISPR筛选

MIC-Drop基本流程(3)


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证明了在体CRISPR筛选的理念,但是这种系统对成像及分析要求很高,需要进一步提高成像的通量与自动化水平。

通讯作者简介:

Science | 大规模在体CRISPR筛选

https://pharmacy.utah.edu/pharmtox/randall/randall-peterson-lab


参考文献:

1. Y. Zhou et al., High-throughput screening of a CRISPR/Cas9 library for functional genomics in human cells. Nature.509, 487–491 (2014).

2. N. E. Sanjana, O. Shalem, F. Zhang,Improved vectors and genome-wide libraries for CRISPR screening. Nat.Methods. 11, 783–784 (2014).

3. S. Parvez et al., MIC-Drop: A platform for large-scale in vivo CRISPR screens. Science (80-. )., eabi8870 (2021).

原文链接:

http://science.sciencemag.org/content/early/2021/08/18/science.abi8870


:原载于2021年8月28日公众号“CNS导读”

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