复杂分子，特别是长链分子，不但存在成键作用，还存在分子内非键相互作 用。相距超过三个化学键的两个原子间，如1—5原子间，分子内非键作用不可 缺少。在聚合物等大分子中，由于二面角的旋转，相距许多个化学键的两个原 子，有时在空间上非常靠近。如果这两个原子间没有分子内非键排斥作用，就有 相互重叠的可能，引起分子模拟过程的失败。
分子内非键相互作用主要包括库仑相互作用和van der Waals相互作用两种 类型。有时，也把分子内氢键作为分子内非键相互作用。分子内非键作用与分子 间非键作用没有本质区别，详细将在第3章讨论。
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