通过多重免疫荧光方法的空间表型分析使研究人员能够可视化和定量蛋白质和生物标志物的表达,从而揭示细胞如何在整个组织景观中相互作用和组织。CODEX技术结合了单细胞生物学和组织学在单细胞空间分辨率的优势,能够在单个组织上成像40多个生物标志物,使得分析兼具高维和空间内容,从而推动无偏差的真正意义上的单细胞生物学发现。
单细胞生物学需要在同一细胞中同时检测几十个生物标志物,已经成为生物发现的主要工具。单细胞生物学技术包括scRNA测序、空间转录组学和单细胞蛋白质组学。这些方法在癌症研究、免疫学、神经科学、传染病研究和药物开发中都很普遍。由于可以从单细胞生物学实验中提取大量的数据,我们相信这些技术会成为生命科学领域重要的手段。单细胞生物学需要真正的单细胞分辨率,这将不受像scRNA-Seq这样没有空间信息的技术及其他新兴的空间生物平台的限制,这些新兴的生物学平台克服了FFPE的障碍,但将其分析限制在预定义的感兴趣区域(ROIs),这些区域的直径超过单细胞直径的几倍。因此,这样的实验不是真正的单细胞技术。
CODEX通过对传统的多重免疫荧光成像(mIF)的改进,有效地解决了以上的问题。为此,CODEX技术为组织样本中40多种蛋白的检测提供了一种高灵敏、可重复和高度复用的方法。
CODEX的技术特点
l 全景空间内容分析而不是局限在感兴趣区域(ROIs),100%获得全景组织信息
l 低至600 nm 或250 nm的真正意义的单细胞分辨率,突破多个细胞所组成的所谓单细胞水平限制
l 一步抗体染色,无需剥色,最小限度减少组织损伤,可支持样本后期更多分析
l 自动化染色成像流程,无需值守,操作简单
在同一个样本中通过单细胞分辨率组织成像和ROIs成像所获得信息的对比。通过CODEX可100%获得全景组织信息,绘制连续的空间图谱,建立真正单细胞水平上的空间生物学信息。
利用CODEX平台获取的区域和单细胞空间生物学数据。左图:角质细胞组成的区域差异很容易通过CODEX不受限制的大组织多重成像捕捉到。右图:真正的单细胞分辨率使亚细胞成分的可视化,如核膜(LaminB1)和质膜(e-cadherin)。
使用36-plex CODEX抗体组研究II期导管腺癌乳腺组织的上皮细胞、癌基因和免疫细胞。最终准确定位到63,056个细胞,分成12个细胞表型,并找到仅44个细胞的罕见的细胞群,而通过ROIs的方法可能会错过该细胞群。
客户焦点:利用CODEX支持药物发现和开发
Sirona Dx是一家总部位于美国俄勒冈州波特兰市的技术合同研究机构(CRO),为制药和生物技术公司提供高度复杂的基因组学和蛋白质组学服务,以支持免疫肿瘤学领域的药物发现和开发。Sirona Dx最近引进了CODEX平台,以支持单细胞、空间分辨率多路成像的发现研究。以下是来自Sirona Dx首席商务官Andrew Brown博士的评价。
你们为什么决定在CODEX平台上增加超高重成像服务?
Dr. Brown:
CODEX平台允许我们研究单个组织样本中非常多的标记物。它是探索性研究和发现性研究的一个极好的工具,提供了单细胞分辨率的空间背景,这是理解肿瘤微环境中细胞之间的关系的关键。
您认为CODEX将如何支持这些检测和生物标志物开发项目?
Dr. Brown:
CODEX系统允许我们在整个组织切片上成像40 +蛋白生物标志物。利用单细胞分辨率生成肿瘤微环境多维表型图的能力,同时有效地保持空间背景,将生物标志物的发现提升到下一个水平。这是一个巨大的数字,特别是对于我们的免疫治疗客户来说,他们认识到仅仅评估特定分子的存在或缺失不足以做出明智的临床决定。
位于Sirona Dx公司的CODEX平台
生物发现需要不受限制地访问研究基质,这样即使是微小的细节也可以通过经验来解决和测量。多重成像技术非常适合于发现研究,特别是当研究人员可以自由扫描整个组织切片时。CODEX使研究人员能够全面扫描组织,并记录组织上的每个细胞的信息。
云准医药科技(上海)有限公司(以下简称:云准)英文名:AccuraMed,用精准和医药相结合。云准成立于2016年,是一家专注于组织生物学标记物检测分析、肿瘤创新药物靶点发现及临床病理免疫诊疗检测方案开发的高科技公司。针对当前热点的肿瘤免疫相关研究致力于为客户提供先进的肿瘤组织免疫微环境分析解决方案。目前我们公司代理Akoya的产品(PhenoCycler平台和PhenoImager平台),并基于此可以提供肿瘤免疫微环境检测相关技术服务。此外云准科技还可以为您提供单细胞+空间多组学技术服务,全方位解析生命的奥秘。云准科技拥有显微切割平台及Thunder活细胞成像平台,为您提供专业的显微切割和Thunder活细胞成像服务。此外我们公司还有配备了3i显微镜成像系统,可以为您提供Marianas LightSheet 成像技术服务和Cleared Tissue LightSheet组织透明化成像服务。此外我们还引进了Agena核酸质谱进行基因分型的检测服务。未来,云准将以创新为驱动力,继续对产品进行深度整合与开发,推动肿瘤免疫、创新免疫疗法和病理诊断技术的突破性发展,必将为肿瘤的诊断和治疗带来革命性变化。
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